//复制一个文件夹里的java文件到另一个文件夹，费了好大事，还是出现这个问题，求高人解决
import java.io.*;
import java.util.*;
class  JavaFileList1
{
public static void main(String[] args) throws IOException
{  
  File dir = new File("d:\\java");
//   File dir1 = new File("d:\\jdg");
  fileToList(dir);
}
public static void fileToList(File dir)throws IOException
{
  File[] files = dir.listFiles();
      
  for(File file : files)
  {
     String str=file.getName();//获取文件名称
        
   if(!file.isDirectory()&&file.getName().endsWith(".java"))//文件不是路径而且".java"结尾为真
   {
       writeToFile(file,str);//传递文件和文件名
   }               
    }
}  
public static void writeToFile(File file,String str)throws IOException
{
   
  File dir1 = new File("d:\\jad");
  BufferedReader bufr = null;
  BufferedWriter bufw = null;
       String[] s=str.split(".java");//以“.java”为符号切割赋给数组s
    System.out.println(s[0]);//s[0]为不带后缀名的文件名称
         
  try
  {
   bufr = new BufferedReader(new FileReader(file));  
   bufw = new BufferedWriter(new FileWriter( "d:\\jdg\\"+s[0]+".txt"));//这里编译的时候没问题，但是一输出就出现异常
                                                                                                     //
   String line = null;
   while((line=bufr.readLine())!=null)
   {
    bufw.write(line);
    bufw.newLine();
    bufw.flush();
   }
  }
  catch (IOException e)
  {
   throw e;
  }
  finally
  {
   try
   {
    if(bufw!=null)
     bufw.close();
   }
   catch (IOException e)
   {
    throw e;
   }
  }
}
}

仔细看这句： "d:\\jdg\\"+s[0]+".txt"));

public static void writeToFile(File file,String str)throws IOException
        {
                File dir1 = new File("e:\\jad");
                //**1：***********如果文件不存在，则创建文件夹**************//
                if(!dir1.exists()){
                        dir1.mkdirs();
                }
                //*************以上三行是我加上去的**********************
                BufferedReader bufr = null;
                BufferedWriter bufw = null;
                //***:2：******************以下两行注释掉了不需要那么麻烦***************
                //***String[] s=str.split(".java");//以“.java”为符号切割赋给数组s
                //***System.out.println(s[0]);//s[0]为不带后缀名的文件名称
         
                try
                {
                        bufr = new BufferedReader(new FileReader(file));  
//        **                bufw = new BufferedWriter(new FileWriter( "d:\\jdg\\"+s[0]+".txt"));//这里编译的时候没问题，但是一输出就出现异常
                //3：上面改了改了一下，路径问题，改成下面的就没有错误了。
                        //如果 d:\\jdg\不存在，会出现异常。  
                        bufw = new BufferedWriter(new FileWriter( new File("e:/jad/"+str)));
                                                                                    
这是我在原来基础上，该了三个地方，有标注的，楼主可以看一下。 其余代码则是是原封不动的。
其实找楼主这么写，感觉不太好，只能拷贝一个文件夹下的.java文件，如果目录下有目录，其中还有.java文件就不能拷贝了
要递归。还有就是感觉楼主写的代码思路不清晰，如果多写两次，相信一定会写得很好的。

从错误提示来看，问题应该是File dir1 = new File("d:\\jad")，中的d:\\jad这个目录不存在造成的，所以要加上一句判断语句，如果这个目录不存在，就创建一个。

import java.io.FileInputStream;
import java.io.FileOutputStream;
import java.io.IOException;

public class FileCopy {
        public static void main(String[] args) throws IOException {
                //生成输入文件的输入流对象
                FileInputStream fin = new FileInputStream("d:/test/a.txt");
                //生成输出文件的输出流对象
                FileOutputStream fout = new FileOutputStream("d:/test/b.txt");
                byte[] buff = new byte[256]; //定义一个永固暂存数据的byte数组
                int len = 0; //每次读取数据的长度
                //循环读取到buff中，如果文件到底，则读取数据的长度小于0
                while ((len = fin.read(buff)) > 0) {
                        fout.write(buff, 0, len); //把数据一次写进输出文件中
                }
                fin.close(); //关闭输入流
                fout.close(); //关闭输出流
        }
}
供参考，写代码要思路清晰，还有就是写文件分隔符是可以写成/这个，就不用转义了或者调用文件分割符那个属性。

已解决，谢谢大家了