张孝祥老师的java高新技术中降到了注解，讲了怎么自定义注解，还讲了怎么给注解添加各种属性。
我想问，这自定义的注解有什么作用呢，怎么样才能和JDK中自带的注解一样，对程序起到控制的作用呢？

你可以理解成你在文件里面相关部位贴了标签，编译器编译的时候会先依据你给的标签处理，如果有需要会把标签传给Java.exe看，没用的标签会撕掉

自定义注解的作用:用于控制类方法的调用，只有拥有某个角色时才能调用。
在帮助文档中加入注解：
要想在制作JavaDoc文件的同时将注解信息加入到API文件中，可以使用java.lang.annotation.Documented。

在自定义注解中声明构建注解文档：

@Documented
public @interface MyAnnotation {

    String[] value1() default "abc";
}

/**

**/
这样的注解在做成自己的java doc文件后，可以做成象API一样的效果，对方法变量等都有注释说明。