import java.io.File;
import java.io.FileInputStream;
import java.io.IOException;
import java.io.InputStreamReader;
import java.io.Reader;


public class InputStreamDemo {
        public static void main(String[] args) throws IOException {
                // TODO Auto-generated method stub
                File f = new File("e:"+File.separator+"text.txt");
                if(!f.exists()){
                        f.createNewFile();
                }
                Reader reader = null;
                reader = new InputStreamReader(new FileInputStream(f));
                char c[] = new char[1024];
                int len = reader.read(c);
                reader.close();
                System.out.println(new String(c,0,len));
        }

}

你的这个是属于最后一步出的问题，如果文件中不存在内容，则返回-1，len=-1；
而在new String(c,0,len)中，如果len=-1的话，则角标发生逻辑错误。改为以下代码就好，
int len = 0;
                String str = null;
                while((len=reader.read(c))!=-1){
                        str = new String(c,0,len);
                }
                reader.close();
                System.out.println(str);

不知道你具体想问什么，只是看着你的代码有问题，不完善。我是这样写的：
public class InputStreamDemo {
        public static void main(String[] args) throws IOException {
                // TODO Auto-generated method stub
                File f = new File("e:"+File.separator+"text.txt");
                InputStreamReade reader = null;
                if(!f.exists()){
                        f.createNewFile();
                }
               int len=0;
                reader = new InputStreamReader(new FileInputStream(f));
                char c[] = new char[1024];
                while(len=reader.read(c)!=-1){
                System.out.println(new String(c,0,len));    }
                reader.close();
               
        }

}

楼主的代码没有错。
从楼主的代码可以看出，是要从E:\test.txt文件中读取内容然后打印到控制台窗口。
这个程序有两种情况：
1，如果E:\test.txt这个文件中有内容，则这个程序运行没有问题。
2，如果E:\test.txt这个文件中没有内容。则
reader = new InputStreamReader(new FileInputStream(f));
char c[] = new char[1024];
int len = reader.read(c);
这三句话执行完，最后reader.read(c);返回的len的值是-1，
然后System.out.println(new String(c,0,len));时，
相当于System.out.println(new String(c,0,-1));，即从c数组的0脚标读到-1脚标，然后将读到的数据转换成字符串，
再打印到控制台。显然没有-1脚标，然后就会出现StringIndexOutOfBoundsException这个异常提示。
楼主是属于第二种情况。楼主得让E:\test.txt这个文件中有内容才行。