例如：
BLL
DALL
MODEL
UI

一些公用的方法如MD5()，要放在哪一层呢？

MD5（）铁定是处理数据的，肯定要放在数据处理层内！Bll层内！，另外建议您在加个Data层！用于数据库访问中间的介质！

可以考虑单独写在公共类里面，我有个项目就是这么做的，实际上一个项目会涉及到很多公共类，所以会有一个单独的公共类的文件夹，独立于UI,BLL,DAL

可以考虑单独写在公共类里面，实际上一个项目会涉及到很多公共类，所以会有一个单独的公共类的文件夹，独立于UI,BLL,DAL

那这个类库是怎么样的一个引用关系？

moedl 不算一层 只能是传递使用的公共类；
DAL 数据访问层 只负责在数据库和业务逻辑之间的数据执行
BLL则是数据层和界面层的桥梁，负责逻辑运算与方法调用
界面层则主要负责前台显示。
md5用于处理数据和一些逻辑判断，所以应在DAL层。